PCB valymo metodas turi būti tinkamai parinktas, atsižvelgiant į užteršimo tipą ir naudojimo scenarijų; vieno-dydžio-visiems-tinkamo požiūrio neįmanoma. Įprastam valymui po pagaminimo ar remonto dažniausiai naudojamas valymas bevandeniu alkoholiu arba specializuotais elektroniniais valikliais. Šie tirpikliai greitai išgaruoja ir nepalieka mažai likučių, todėl jie tinka fliuso likučiams, lengvoms alyvos dėmėms ir dulkėms pašalinti. Eksploatacijos metu paprastai švelniai nušluostoma grandinės linijų kryptimi naudojama šluostė be pūkelių arba minkštas šepetys, vengiant per didelės jėgos, kuri gali atlaisvinti komponentus arba pažeisti litavimo jungtis. Srityse, kuriose yra didelis vietinis užterštumas, galima naudoti valymo nuo taško{8}}į-tašką metodą, problemą sprendžiant palaipsniui, o ne pakartotinai valant didelius plotus.
Jei ant PCB yra sunkiai pasiekiamų teršalų, pvz., kanifolijos sankaupų, pramoninių alyvos dėmių arba ilgalaikės oksidacijos likučių, galima apsvarstyti ultragarsinį valymą. Šis metodas apima grandinės plokštės panardinimą į specializuotą valymo tirpalą, kur dėl aukšto-dažnio vibracijų sukuriamo kavitacijos efekto pašalinami teršalai iš mažyčių plyšių, todėl valymas atliekamas kruopščiau nei naudojant rankinius metodus. Tačiau labai svarbu kontroliuoti valymo laiką ir skysčio sudėtį, kad nebūtų pažeisti jautrūs komponentai (pvz., jungtys, relės ir mikrofonai). Po valymo būtina kruopščiai išdžiovinti; kitu atveju likutinė drėgmė gali sukelti trumpąjį jungimą arba koroziją.
